淮河流域自然环境及人为影响（中国工程院重大咨询项目 淮河流域环境与发展问题研究）

海河流域河流生态系统健康研究

海河流域平原河流生态保护与修复模式研究

辽河流域辽河流域生态水保障与时空优化调度研究

海河流域典型河流生态水文过程与生态修复研究

中小河流生态治理研究实践

黄河流域生态保护研究

典型河流水质提升方案研究

东江河流生态健康评价研究

城市河流片区精准治污决策研究

海河流域水治理战略研究

城市化、半城市化对河流生态影响研究：以北运河流域为例

南方河流生态廊道保护与修复研究

浑河流域森林生态补偿机制研究

赤水河流域生态补偿技术研究

海河流域生态环境演变规律研究：以滦河流域和漳卫南流域为例

伊洛河流域综合规划环境影响研究

河流堤防建设干扰区生态修复研究

海河流域水生态修复探索与研究

黑河流域环境影响的时空差异研究

城市河流生态修复与治理技术研究

淮河流域土石山区水土保持研究

黄河流域城市生态软实力建设研究

大清河流域生态环境演变趋势研究

美姑河流域地质灾害与防灾减灾研究

赤水河流域生态水文过程研究

辽河流域水污染物排放限值研究

山东省河流水环境容量研究

汉江中下游河流生态健康评价研究

寒区水循环模拟与河流生态需水过程研究